בן מרים ואלי. נולד בעיר וושינגטון בארצות הברית, בעת שהות המשפחה שם עקב שליחות עיתונאית של האב, בן בכור להוריו. במלאת ליוני שנתיים, שבה המשפחה לארץ אל מקום מגוריה בירושלים. יוני למד בבית-הספר היסודי 'בית הילד' והמשיך את לימודיו בבית-הספר התיכון שליד האוניברסיטה. יוני היה ילד לבבי ובעל קסם אישי, שיצר קשרים חברתיים ענפים עם בני נוער מכל שדרות החברה. היה בעל נוכחות בולטת בכל מעגל חברתי שנקלע אליו. השתתף בתכנית הטלוויזיה הפופולרית 'ריץ רץ'. היה בעל כושר מנהיגות טבעי ומודעות חברתית וציבורית מפותחת. היה פעיל בתנועת הצופים בשבט "מודיעין", כחניך, מדריך וראש גדוד. יוני גדל בבית בעל זיקה לענייני ציבור ולפיכך ביקש להרחיב את ידיעותיו בהתמדה בכל הנוגע לחברה הישראלית. היו לו דעות מגובשות, שאותן נהג להשמיע בבטחה, ובמתינות. תמיד גילה סובלנות וכבוד לדעותיהם של אחרים כאשר היו שונות משלו. היה צעיר בעל חוש אחריות הן בחוג המשפחה וביחסו לאחיו הצעירים ממנו - שאול והלל והן בתנועה ולאחר מכן במסגרת הצבאית. יוני התגיס לשירות בצה"ל בחודש ינואר 1986 במסגרת גרעין נח"ל, שהתכוון להתיישב בהר עמשא. עבר קורס מ"כים ופיקד על כיתת טירונים. לאחר מכן הצטרף לאגד 214. סיים קורס קציני סיור שבסיומו הדריך בבית-הספר לקצינים ושימש קמב"ץ אגד 214. בתום תקופה של פחות משנה בתפקיד זה, מונה למפקד פלוגת טירונים של היחידה. כחבר וכמפקד התייחס בהבנה וברגישות רבה לעמיתיו ולפקודיו. הוא נטל על עצמו משימות נוספות על-מנת להקל על בעלי המשפחות ששירתו עימו במסגרת שירות המילואים שלהם, מתוך התחשבות מיוחדת בהם. יונתן נהרג בתאונת דרכים, כחודשיים לפני שיחרורו המיועד מצה"ל. הניח הורים ושני אחים - שאול והלל.